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Oña se asienta a orillas del río Oca, en pleno Espacio Natural de los Montes Obarenes.
La Casa de la Judería está situada en Oña, al norte de la provincia de Burgos, en el límite entre la Bureba y las Merindades, a 65 km de la capital y a 87 km de Bilbao.
Coordenadas GPS:
Latitud: 42º 44' 4" N
Longitud: 3º 24' 48" W