Perteneciente a la Comarca, Merindad y Partido Judicial de Estella, Zuñiga se extiende hacia la parte occidental de su Merindad, que corresponde ya al Valle Alto del Ega. El río Ega discurre por el sur de su municipio. Destacamos la Reserva Natural del Barranco de Lasia, que contiene en sus 70 Hectáreas el desfiladero que traza el río Ega y los carrascales de especial interés ecologico, en las laderas de este valle alto, que se trata de preservar. Cuenta Zuñiga, además, con un hermoso encinar.
Su núcleo urbano conserva las características típicas de su trazado medieval. Rodeado por una muralla de la que aún se conservan algunos tramos y torreones originales de la época. En las fachadas de algunas casas, podemos admirar escudos nobiliarios, testimonio de sus epocas de esplendor.
De su arquitectura, destacamos la Ermita de Nuestra Señora de Arquijas, a unos 3 Km. fuera del pueblo, datada en el siglo XIII, de estilo protogotico cisterciense, reformada en el XVI, momento en que se enriqueció con unas interesantes pinturas murales. El último domingo de septiembre tiene lugar la romería a esta ermita, que concluye con una comida popular. Asimismo resulta destacable de su conjunto arquitectonico la Iglesia de Santa María (Siglo XVI), de estilo gótico renacentista, con un rico retablo de la misma época.