Perteneció a un antiguo convento franciscano. El templo se inició en 1694 y responde al modelo de iglesia conventual barroca con planta de cruz latina y cúpula oval sobre el crucero. Los muros aparecen decorados con pinturas al fresco. Ostenta el templo un buen retablo barroco de hacia 1730, que preside una imagen coetánea de Jesús Nazareno, patrón de Baena.