El Monasterio de Valvaneda se encuentra emplazado en plena montaña, a 1.026 metros de altura sobre el nivel del mar, en la Sierra de San Lorenzo (Sierra de la Demanda) en las estribaciones de los Pancrudos, a 14 km de la localidad en Anguiano, a cuya jurisdicción pertenece y a 54 km de lo Logroño, capital de La Rioja.
Circulan varias teorías sobre la etimología del vocablo Valvanera, una dice que deriva del nombre latino Vallis Venaria, es decir, Valle de las Venas por la riqueza del terreno en agua, el cual se traduce en pequeños cursos de agua, arroyuelos y fuentes. El río Valvanera, afluente de Najerilla, el cual desemboca en el río Ebro, es fuente de vida a su vez en ese valle donde abundan especies de la fauna riojana tales como : truchas, anguilas y barbos. Otros la buscan en Vallis Venie o Valle de la Venia, que significa Valle del Perdón.