De origen árabe. Su nombre, muy repetido en la toponimia española, parece proceder del árabe al-gar que significa "la cueva", y se trataría de un doble diminutivo de Algar.

En las proximidades de la villa se produjo una importante batalla entre las tropas musulmanas del reino nazarí de Granada y las de Isabel la Católica. Fue comprada a Felipe III por D. Mateo de Lisón y Biedma.


Algarinejo, enclavado en el Poniente Granadino, el también llamado "surco intrabético", participa de las características de este singular espacio, últimos peldaños de la escalera de altiplanicies que comunican el Levante con Andalucía. De orografía accidentada, ofrece una gran diversidad de paisajes; en su término serpentea el río Pesquera, que alimenta el embalse de Iznájar, próximo al municipio.